13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2114 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2114  peptidase U32  100 
 
 
412 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1027  peptidase U32  45.54 
 
 
405 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3233  peptidase U32  45.05 
 
 
405 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0514  peptidase U32  28.23 
 
 
388 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000252039  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2571  peptidase U32  27.59 
 
 
379 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.746078  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1527  peptidase U32  35.27 
 
 
347 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00774566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1040  Collagenase and related protease-like protein  25.49 
 
 
360 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1305  hypothetical protein  24.81 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.122473  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  25.16 
 
 
453 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  27.69 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  27.62 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  27.62 
 
 
409 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  32.2 
 
 
419 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>