14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1944 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
275 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4773  hypothetical protein  51.32 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4666  hypothetical protein  51.32 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1650  hypothetical protein  51.72 
 
 
260 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0558  hypothetical protein  50.38 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  28.4 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  25.73 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.64 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  26.16 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  25.94 
 
 
346 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  26.17 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  23.58 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.39 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.67 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>