17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1708 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1708  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0819  transcriptional regulator, AbrB family  52.27 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  52.5 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0407  AbrB family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 81 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000503263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  35.19 
 
 		 92 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0868  transcriptional regulator, AbrB family  48.57 
 
 		 81 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.300001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1837  transcriptional regulator, AbrB family  34.78 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746962  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  45 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2773  transcriptional regulator, AbrB family  41.03 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2441  transcriptional regulator, AbrB family  43.9 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.189768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>