21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1464 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  309  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  46.3 
 
 
166 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  50 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  38.27 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  41.33 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  40.43 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  34.38 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  36.03 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  28.78 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  38.95 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  42.86 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  29.41 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  50 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  50 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  39.44 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  38.16 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  28.18 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  34.88 
 
 
180 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  35.21 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  25.69 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>