12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0132 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0132  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 101 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  55.88 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0618  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.686113  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  28.42 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2579  DNA polymerase beta domain protein region  33.73 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0226181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  30.84 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  32.08 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>