36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3516 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3516  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  100 
 
 		 89 aa  180  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.107593  hitchhiker  0.00119536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3166  periplasmic nitrate reductase NapD  39.47 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  37.65 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  36.9 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1592  NapD family protein  40.85 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2982  napD protein  35.37 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  35.29 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  33.8 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  33.8 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0848  NapD family protein  30.49 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.395877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  32.39 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  33.78 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  30.49 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0825  NapD family protein  30.49 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4010  periplasmic nitrate reductase subunit NapD  33.73 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3510  NapD family protein  30.49 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0860  NapD family protein  30.49 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  31.33 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  31.4 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4204  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  32.93 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  32.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49230  NapD protein of periplasmic nitrate reductase  32.93 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085279  hitchhiker  0.00981285 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000512  periplasmic nitrate reductase component NapD  29.07 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2367  NapD protein  34.43 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  32.86 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0624  NapD family protein  30.67 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1509  periplasmic nitrate reductase chaperone NapD  26.32 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3956  NapD family protein  28.38 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3223  hypothetical protein  31.51 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2714  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  28.92 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4109  NapD family protein  29.58 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1722  NapD  32.58 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  26.83 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  28.38 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  28.38 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1741  NapD family protein  32.47 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295398  normal  0.0137625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>