17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1830 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 201 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  49.5 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  38.78 
 
 		 174 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  38.67 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  37.06 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  42.65 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  35.66 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  35.76 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  30.63 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  32.76 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  27.54 
 
 		 364 aa  58.2  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  27.61 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  28.68 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  28.12 
 
 		 378 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  24.56 
 
 		 364 aa  51.6  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  25.21 
 
 		 918 aa  45.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>