15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0161 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  100 
 
 		 440 aa  865    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6488  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  29.3 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  22.76 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.33 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.33 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.33 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  20.93 
 
 		 612 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>