31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4440 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2447  putative RNase H  46.67 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  39.84 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  42.74 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  36.59 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3649  hypothetical protein  35.54 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  31.36 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  42.11 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  31.75 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  41.53 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  41.03 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  41.28 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  36.75 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2812  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0958  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0557977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  35.2 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1301  hypothetical protein  29.55 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1236  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1175  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.399464 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  28.8 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  38.39 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  37.4 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.9 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  32.5 
 
 		 336 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3083  hypothetical protein  34.45 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  23.97 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>