28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3649 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3649  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  253  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  54.62 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  55.46 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2812  hypothetical protein  46.22 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  46.09 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0958  hypothetical protein  45.38 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0557977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  43.1 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  36.52 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  35.59 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  35.77 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  35.58 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.09 
 
 		 338 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2447  putative RNase H  34.75 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  31.58 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  32.74 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  30.91 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  31.93 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  31.03 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  30.97 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  30.56 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  32.76 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  28.04 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1301  hypothetical protein  27.19 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1175  hypothetical protein  26.21 
 
 		 131 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.399464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>