14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3227 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  362  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  44 
 
 		 218 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  43.05 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  42.68 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  44.3 
 
 		 279 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  45.22 
 
 		 220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  42.94 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  36.88 
 
 		 283 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  34.12 
 
 		 220 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  34.12 
 
 		 220 aa  88.6  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  34.29 
 
 		 280 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  44.44 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  32.37 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>