16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0512 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  41.21 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  41.21 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  42.93 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0590  hypothetical protein  34.83 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  32.45 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  31.18 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  30.85 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  32.09 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  26.6 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  28.12 
 
 		 183 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  27.81 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  27.6 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  26.52 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>