10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0879 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0879  HNH endonuclease family protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00646503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1310  HNH nuclease  40 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.944782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 323 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1851  HNH endonuclease  32.31 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  31.25 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  32.79 
 
 		 348 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3476  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.274553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3809  hypothetical protein  38.1 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 279 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>