19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1897 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  34.72 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  39.18 
 
 
157 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  33.72 
 
 
163 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  27.43 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  31.86 
 
 
160 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1146  hypothetical protein  30.58 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  35.42 
 
 
308 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  62.5 
 
 
344 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4217  hypothetical protein  61.54 
 
 
120 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188082  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  32.58 
 
 
451 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  30.97 
 
 
139 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  36.36 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  35.94 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  28.37 
 
 
513 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
352 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1455  hypothetical protein  32.05 
 
 
136 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  29.41 
 
 
352 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>