More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1183 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  100 
 
 		 309 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.47 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  57.05 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  54.55 
 
 		 323 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  55.23 
 
 		 314 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  53.14 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  53.18 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.01 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  52.3 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  51.52 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  51.97 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 313 aa  331  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  52.22 
 
 		 320 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 		 319 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  52.22 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.19 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  51.54 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.37 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  49.18 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  51.88 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 		 335 aa  321  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  51.35 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  49.35 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.33 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.2 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.47 
 
 		 313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.85 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  46.38 
 
 		 316 aa  311  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 302 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  46.13 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  48.66 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  48.18 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  48.18 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.64 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  48.51 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  48.18 
 
 		 309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  48.18 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.83 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  48.18 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  48.18 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.32 
 
 		 341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  47.85 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  47.85 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.52 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.34 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  47.56 
 
 		 313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.79 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.82 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  49.14 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  48.53 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  49.33 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  46 
 
 		 310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.45 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  46.73 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.51 
 
 		 314 aa  301  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  47.39 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  45.97 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  44.63 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  46.43 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.35 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.68 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  47.18 
 
 		 308 aa  298  8e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  45.97 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1882  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.2 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  47.52 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.04 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.97 
 
 		 309 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  50.92 
 
 		 316 aa  291  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  45 
 
 		 310 aa  291  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.84 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  47.4 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  45.21 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  47.37 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.48 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.89 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  44.67 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  44.59 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3709  ATPase  45.33 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.51 
 
 		 342 aa  289  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.31 
 
 		 321 aa  289  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  42.16 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  44.67 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.66 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  45 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>