21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0090 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  340  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  40.83 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  32.34 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  37.3 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  29.41 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  35.82 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  26.21 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  27.03 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  30.43 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  27.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2373  hypothetical protein  31.87 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  30.23 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  26.49 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  22.97 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  30.56 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0868  rod shape-determining protein MreD  25.15 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000649677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1672  hypothetical protein  26 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  26 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  23.61 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>