35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5007 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5007  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0563553  hitchhiker  0.00499948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2850  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.852328  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1748  Methyltransferase type 12  37.44 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0996  methyltransferase type 12  28.85 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0100468  hitchhiker  0.00269187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.35 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  30.58 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2224  methyltransferase type 12  26.58 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0041  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.49 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.921804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  24.02 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.83 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  22.58 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 279 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.45 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5458  methyltransferase type 12  38.27 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.17 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5079  methyltransferase type 12  38.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.73 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5167  methyltransferase type 12  38.27 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.48 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.41 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.39 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3170  Methyltransferase type 11  22.67 
 
 		 237 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.91 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  30.28 
 
 		 278 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  22.83 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>