16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4144 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  100 
 
 		 1092 aa  2259    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  26.44 
 
 		 1229 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  24.4 
 
 		 1129 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  33.79 
 
 		 1065 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1152 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1152 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  25.41 
 
 		 1263 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  27.11 
 
 		 1084 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1079 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1056 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1322 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  26.49 
 
 		 1837 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  23.39 
 
 		 1129 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1857 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  30.77 
 
 		 1359 aa  44.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  45.45 
 
 		 3027 aa  44.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>