32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2373 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3474  VanZ family protein  32.24 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000194917  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  40.79 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  32.87 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5115  hypothetical protein  47.83 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0867  teicoplanin resistance protein  45.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  44.44 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4846  hypothetical protein  48.53 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5083  hypothetical protein  48.53 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0870  VanZ family protein  43.06 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5212  hypothetical protein  48.53 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4297  hypothetical protein  45.59 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1046  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0067199999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1049  vanZ protein, putative  44.12 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.621429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0886  teicoplanin resistance protein vanZ  41.67 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0750721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  40.74 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  41.18 
 
 		 210 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2680  VanZ family protein  43.48 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  40.54 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  35.8 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  38.27 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0194  VanZ family protein  35.48 
 
 		 398 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0242473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  40.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  36.49 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1422  VanZ family protein  28.67 
 
 		 223 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08310  VanZ family protein  25 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3803  VanZ like protein  35.71 
 
 		 364 aa  43.9  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000277971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  34.67 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  29.91 
 
 		 361 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  33.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1257  glycopeptide antibiotics resistance protein  36.23 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000512133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>