30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2470 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2470  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  100 
 
 
293 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0834  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  27.06 
 
 
293 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0851  sporulation factor SpoIIGA  26.38 
 
 
306 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000121402  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2063  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  25.74 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000263104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0784  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  26.13 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000488598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1554  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  27.65 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000760795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09140  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.97 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0685  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  24.18 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1029  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  24.52 
 
 
308 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000260513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0446  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  25.89 
 
 
297 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1899  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  24.66 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2002  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  28 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000249092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3756  sporulation sigma-E factor processing peptidase  23.45 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3647  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  23.45 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4044  sporulation sigma-E factor processing peptidase  23.45 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000128036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3664  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  23.45 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000467188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3958  sporulation sigma-E factor processing peptidase  23.38 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000155556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3920  sporulation sigma-E factor processing peptidase  23.7 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000219201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2554  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  24.67 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1235  sporulation sigma-E factor processing peptidase  22.95 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503197  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3950  sporulation sigma-E factor processing peptidase  23.55 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000829364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3732  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  23.1 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000105544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1734  sporulation factor SpoIIGA  22.89 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4055  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  24.76 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000601158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2016  sporulation factor SpoIIGA  22.54 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.483193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1065  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  23.83 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00162251  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1289  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  22.59 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1427  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  24.05 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0623098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4006  sporulation sigma-E factor processing peptidase  21.67 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00108073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1309  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  24.89 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000941683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>