17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1603 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 		 173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  57.56 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  51.48 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  53.01 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  47.65 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  46.11 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  49.08 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0755  4-vinyl reductase 4VR  46.34 
 
 		 182 aa  160  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  27.15 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  27.92 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  27.34 
 
 		 272 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  25.62 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  31.58 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  26.67 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>