299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0052 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 78 bp  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 78 bp  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  94.2 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  95.31 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  95.31 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  95.31 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  95.31 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0022  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0060  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.695834  hitchhiker  0.0000996244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0014  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0013  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0795  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4562  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  92.19 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  88.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00004  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0073  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0109  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0024  tRNA-Asp  90.62 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.16238  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0025  tRNA-Asp  90.62 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103227  normal  0.238575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0017  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000152694  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp03  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5085  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.453014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4643  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00729353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4708  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.806032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0085  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0086  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4644  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00029583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0014  tRNA-Asp  90.62 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0054  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  0.0552316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5009  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5008  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0329155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>