More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0022 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0022  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.695834  hitchhiker  0.0000996244 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  92.65 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  92.65 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0047  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.31974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0046  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000290325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0045  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.316389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0017  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0019  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0044  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0014  tRNA-Asp  96.36 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0014  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4562  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0795  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4563  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0014  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0030  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0013  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0015  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0044  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0014  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0035  tRNA-Asp  96.08 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0062  tRNA-Asp  96.08 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000079557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0028  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00318123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0037  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000102957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0298  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00212865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0054  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566349  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0054  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000552526  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0096  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000496509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  90.32 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0054  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0063  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164235  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0052  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0029  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643292  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0777  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0514  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.30376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0006  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000433123  normal  0.0757617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0062  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000866023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0511  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.304577  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2942  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2945  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.393325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2948  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2625  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2628  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2631  tRNA-Asp  91.53 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.830892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>