More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0024 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0024  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.16238  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0025  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103227  normal  0.238575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6033  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.908357  normal  0.208238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4317  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.771522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6034  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.93695  normal  0.213156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0014  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0015  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0016  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.816839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0026  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522695  normal  0.33035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0018  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0034  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0035  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0027  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.961867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4316  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0026  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.968227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0027  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.76766  normal  0.328825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0063  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748951  normal  0.206184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0027  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000271545  normal  0.890927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0018  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0795  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0026  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000028925  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0024  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0025  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000839406  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>