27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2124 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  48.2 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  46.81 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  44.93 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  40.81 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  33.57 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  30.04 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.19 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  31.76 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.87 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.87 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.93 
 
 		 415 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  25.84 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 162 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.05 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1583  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.932581  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 155 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.89 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>