18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0207 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0207  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.385068  hitchhiker  0.00420138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0198  hypothetical protein  74.32 
 
 
223 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3002  hypothetical protein  52.31 
 
 
234 aa  244  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.407926  hitchhiker  0.0038842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3519  hypothetical protein  50.89 
 
 
223 aa  242  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2092  hypothetical protein  50.67 
 
 
226 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.350864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4000  SAM-dependent methyltransferase  45 
 
 
227 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.021508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3315  hypothetical protein  45.33 
 
 
228 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3295  SAM-dependent methyltransferase  38.12 
 
 
231 aa  184  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2858  hypothetical protein  40.54 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1786  hypothetical protein  33.94 
 
 
228 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1787  hypothetical protein  33.48 
 
 
228 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1075  hypothetical cytosolic protein  33.33 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.969633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1532  hypothetical protein  31.58 
 
 
264 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0967  hypothetical protein  32.87 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0224  hypothetical protein  29.8 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2033  hypothetical protein  30.45 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.848941  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2235  hypothetical protein  34.11 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0316491  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4389  hypothetical protein  45.76 
 
 
81 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.253368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>