13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0017 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0017    100 
 
 		 400 bp  793    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    87.1 
 
 		 403 bp  347  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    89.58 
 
 		 403 bp  246  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    88.33 
 
 		 403 bp  230  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_SetmRNA1  sRNA  96.88 
 
 		 359 bp  56  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0060    96.67 
 
 		 358 bp  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0569  sRNA  93.94 
 
 		 375 bp  50.1  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0494255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  96.55 
 
 		 365 bp  50.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    96.55 
 
 		 370 bp  50.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0033    96.55 
 
 		 352 bp  50.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0024    93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.712325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0025    93.75 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>