36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1080 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  36.08 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  33.01 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  29.08 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.93 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  30.3 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  27.04 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  27.08 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  35.96 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.11 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  26.18 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  24.06 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  41.54 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  32.43 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  22.28 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.42 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  31.08 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.78 
 
 		 453 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  34.78 
 
 		 453 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  38.36 
 
 		 451 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  38.24 
 
 		 453 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  32.74 
 
 		 455 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.27 
 
 		 449 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 		 237 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 		 449 aa  41.2  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>