30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0042 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  45.27 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.77 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  44.97 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  38.95 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  35.86 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.71 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  30.3 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.4 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 		 231 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  34.85 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  32.65 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  30.57 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  30.57 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  45.98 
 
 		 158 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  47.31 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  45.98 
 
 		 158 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  43.68 
 
 		 158 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.18 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  32.81 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  52.31 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.59 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  26.86 
 
 		 228 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.43 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  34.41 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>