43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0801 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  77.66 
 
 
291 aa  487  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  79.93 
 
 
291 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  72.16 
 
 
291 aa  455  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  72.13 
 
 
292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.6 
 
 
291 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  67.03 
 
 
285 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  49.65 
 
 
284 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  49.65 
 
 
284 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  278  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  47.29 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.64 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  48.4 
 
 
291 aa  263  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  48.2 
 
 
293 aa  262  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.28 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  47.81 
 
 
297 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.8 
 
 
293 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  46.59 
 
 
293 aa  232  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.96 
 
 
292 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  37.32 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  36.39 
 
 
299 aa  155  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  35.71 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  36.18 
 
 
299 aa  149  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  35.37 
 
 
297 aa  147  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  29.41 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.93 
 
 
358 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  34.38 
 
 
374 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  24.51 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.78 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.42 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  27.64 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27.72 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.5 
 
 
360 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  23.55 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  27.14 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  27.32 
 
 
387 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.68 
 
 
396 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.74 
 
 
401 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  26.63 
 
 
383 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.42 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.87 
 
 
389 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  24 
 
 
371 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>