25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0590 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0590  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000331231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0748  adenylosuccinate lyase  59.7 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1053  adenylosuccinate lyase  59.33 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1178  adenylosuccinate lyase  58.96 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.367751  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0703  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.979242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1984  adenylosuccinate lyase  43.45 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0679  adenylosuccinate lyase  39.18 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1021  heat shock protein DnaJ domain protein  36.26 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  37.7 
 
 		 645 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  40 
 
 		 318 aa  45.4  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  34.92 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  36.07 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  39.68 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1001  heat shock protein DnaJ domain protein  38.1 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  33.04 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  39.68 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.67 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.67 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  35.09 
 
 		 412 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  34.85 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  38.33 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  30.99 
 
 		 305 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  33.78 
 
 		 361 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>