22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1984 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1984  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0703  adenylosuccinate lyase  66.91 
 
 
274 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.979242  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0679  adenylosuccinate lyase  41.54 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0590  adenylosuccinate lyase  43.45 
 
 
268 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000331231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1053  adenylosuccinate lyase  38.2 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0748  adenylosuccinate lyase  38.2 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1178  adenylosuccinate lyase  38.2 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.367751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1021  heat shock protein DnaJ domain protein  34.18 
 
 
276 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  45.76 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  41.43 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1842  heat shock protein DnaJ-like  42.37 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  46.43 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1001  heat shock protein DnaJ domain protein  36.07 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1994  heat shock protein DnaJ domain protein  30.77 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1244  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  31.31 
 
 
511 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  38.81 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14554  predicted protein  37.5 
 
 
495 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.186428 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  44.64 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1310  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.33 
 
 
143 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1420  heat shock protein DnaJ domain protein  36.67 
 
 
191 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>