29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0679 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0679  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0703  adenylosuccinate lyase  43.38 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.979242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1984  adenylosuccinate lyase  41.54 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0590  adenylosuccinate lyase  39.18 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000331231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1053  adenylosuccinate lyase  36.57 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0748  adenylosuccinate lyase  36.57 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1178  adenylosuccinate lyase  36.19 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.367751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1021  heat shock protein DnaJ domain protein  33.22 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1842  heat shock protein DnaJ-like  27.55 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  40 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  34.83 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  38.89 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1413  hypothetical protein  32.81 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6005  heat shock protein DnaJ-like protein  30.88 
 
 		 645 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  38.89 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01050  hypothetical protein  31.82 
 
 		 332 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>