111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0606 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
305 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  80.12 
 
 
318 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  70.3 
 
 
291 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  67.22 
 
 
296 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  53.33 
 
 
273 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  53.18 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  53.18 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  53.18 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  53.18 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  53.18 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  50.84 
 
 
271 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  50.17 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  50.17 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  50.17 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  50.17 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  50.5 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  50.5 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  52.17 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  52.17 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  50.17 
 
 
271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  52.51 
 
 
277 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  50.17 
 
 
271 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  50.5 
 
 
273 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  40 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  43.31 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  40.72 
 
 
288 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  41 
 
 
256 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  39.6 
 
 
262 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  40.73 
 
 
262 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  40.59 
 
 
262 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  41.01 
 
 
284 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  40.4 
 
 
262 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  37.38 
 
 
275 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  39.33 
 
 
259 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  39.67 
 
 
259 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  39.93 
 
 
262 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  38.56 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  39.46 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  38.61 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  38.61 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  38.61 
 
 
262 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  40.29 
 
 
286 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  40 
 
 
257 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  36.27 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  38.49 
 
 
283 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 
284 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  35 
 
 
259 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.58 
 
 
268 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  33.77 
 
 
271 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  32.24 
 
 
296 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  33.77 
 
 
270 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  34.92 
 
 
276 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  31.58 
 
 
296 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31 
 
 
267 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.72 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  29.43 
 
 
271 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  30.2 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  29.67 
 
 
257 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  28.62 
 
 
257 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  27.36 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.3 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  25.41 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.25 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  24.58 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.57 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.39 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.67 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  26.67 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  24.4 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  26.94 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  25.83 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  24.18 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  21.72 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  41.38 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2298  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.11 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  42.19 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  42.19 
 
 
250 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 
241 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  22.31 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3726  heat shock protein DnaJ domain protein  41.27 
 
 
121 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  35.19 
 
 
235 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.6 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  21 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  43.48 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.76 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.21 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.04 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  37.04 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  43.4 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  20.25 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0553  heat shock protein DnaJ domain protein  39.71 
 
 
255 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.44 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl438  heat shock protein chaperone  34.25 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  35.85 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  38.89 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03463  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G05400)  38.6 
 
 
519 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000832444 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89325  Molecular chaperone (DnaJ superfamily)  40.35 
 
 
644 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>