50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2125 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
431 aa  862    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  73.09 
 
 
430 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.43 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.77 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  25.87 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.19 
 
 
278 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  25.26 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.63 
 
 
325 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.58 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.56 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.37 
 
 
275 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  22.06 
 
 
420 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  25.93 
 
 
529 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.05 
 
 
280 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.25 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.17 
 
 
456 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  25.31 
 
 
529 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  28.05 
 
 
534 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  28.05 
 
 
534 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.98 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  25.31 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.93 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  25.31 
 
 
529 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  25.44 
 
 
528 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.36 
 
 
242 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
529 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  24.69 
 
 
529 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.18 
 
 
241 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.86 
 
 
534 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  26.38 
 
 
534 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.98 
 
 
547 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.32 
 
 
536 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  25.77 
 
 
534 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  24.07 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.58 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.24 
 
 
277 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  26.83 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  24.07 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  24.17 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  25.12 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2937  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.34 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0715772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.79 
 
 
541 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  19.49 
 
 
549 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.95 
 
 
532 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2744  histidine kinase  24.65 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00108764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3043  histidine kinase domain-containing protein  23.72 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3042  histidine kinase domain protein  23.29 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00679309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.61 
 
 
534 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.1 
 
 
543 aa  43.1  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2724  sensor histidine kinase  24.65 
 
 
438 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>