17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1453 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  100 
 
 
180 aa  350  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  38.29 
 
 
183 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  35.48 
 
 
183 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  36.42 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  42.55 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  34.1 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  33.53 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  36.59 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1255  protein of unknown function DUF1393  32.93 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000641717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  29.17 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  28.4 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0064  hypothetical protein  30.95 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0313  protein of unknown function DUF1393  39.81 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1395  protein of unknown function DUF1393  32.9 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0097  hypothetical protein  29.21 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0493  hypothetical protein  31.97 
 
 
163 aa  41.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>