23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3154 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  362  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  37.78 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  38.29 
 
 
180 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  34.88 
 
 
166 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  32.96 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  32.96 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  37.27 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  37.58 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  33.1 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0064  hypothetical protein  30.86 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1395  protein of unknown function DUF1393  32.34 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1255  protein of unknown function DUF1393  40.45 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000641717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  25.44 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  32.5 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0916  hypothetical protein  31.69 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3322  hypothetical protein  33.82 
 
 
233 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3336  hypothetical protein  28.28 
 
 
207 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3336  hypothetical protein  32.35 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3363  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3117  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3007  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3040  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.709891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3316  hypothetical protein  32.35 
 
 
202 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>