14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0313 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0313  protein of unknown function DUF1393  100 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  39.81 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  39.81 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  39.81 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1260  hypothetical protein  29.31 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.575239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  32.16 
 
 
166 aa  61.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  30 
 
 
260 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  28.32 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  22.91 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  27.22 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0097  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  27.01 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0878  hypothetical protein  29.3 
 
 
286 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.9856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  27.4 
 
 
217 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>