15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0493 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0493  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  31.85 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0916  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  29.19 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  29.73 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  30.72 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0064  hypothetical protein  29.14 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  30 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
260 aa  42  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  31.97 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  31.76 
 
 
177 aa  40.8  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0097  hypothetical protein  27.57 
 
 
188 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>