17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1191 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  350  8.999999999999999e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  98.31 
 
 
178 aa  345  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  35.37 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  32.96 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  35.67 
 
 
260 aa  74.7  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  33.53 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  31.93 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  30.86 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1260  hypothetical protein  25.99 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.575239  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0313  protein of unknown function DUF1393  39.81 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0097  hypothetical protein  29.48 
 
 
188 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  27.61 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  34.94 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0493  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0916  hypothetical protein  31.47 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1395  protein of unknown function DUF1393  30.09 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>