17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3004 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  100 
 
 
179 aa  338  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  41.73 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  47.71 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  45.87 
 
 
185 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  45.87 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  45.59 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  46.3 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  41.86 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  41.86 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  41.86 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  40.87 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  41.13 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  41.13 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  40.79 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  43.59 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  34.95 
 
 
223 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2526  hypothetical protein  39.82 
 
 
227 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>