57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1404 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  41.3 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  41.45 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  40.36 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  40.87 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  39.66 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  41.33 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  41.28 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  41 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  43.11 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  37.5 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  42.22 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  35.71 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  39.38 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  38.94 
 
 		 235 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  37.28 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  38.6 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  39.82 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.16 
 
 		 226 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  39.82 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  39.82 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  39.82 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  36.84 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  37.28 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  35.37 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  37.05 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  35.37 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  37.28 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  35.37 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  36.68 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  35.37 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  38.5 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  36.24 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  35.81 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  38.05 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  34.93 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  35.81 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  37.61 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  35.09 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  34.21 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  36.56 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  33.63 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  32.74 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  28.81 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  23.65 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  32.58 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  28.57 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  26.79 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  23.77 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  29.89 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  27.95 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  23.9 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>