27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0209 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  100 
 
 
210 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  38.25 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  37.57 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  32 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1160  YhhN-like protein  38.35 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0198509  normal  0.10555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  29.96 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.64 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  35.62 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  25.48 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  34.11 
 
 
246 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  32.5 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  33.54 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  34.18 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  33.58 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  38.75 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  29.08 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  25.48 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  31.47 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  31.62 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  33.97 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  30.19 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>