82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2211 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  100 
 
 		 171 aa  318  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  37.35 
 
 		 162 aa  84.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3735  colicin V production protein  40.97 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0168626  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  38.71 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  36.14 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  34.09 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2566  colicin V production protein  39.37 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  31.06 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  27.74 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  32.59 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  34.75 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3247  colicin V production protein  41.13 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000527526  unclonable  0.0000129544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  30.82 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  29.81 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  23.64 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  29.8 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  23.64 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  26.62 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  29.33 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  25.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  27.41 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  25.62 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  27.41 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  27.41 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  28.82 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  27.41 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  27.56 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  27.41 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.7 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  25.62 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  25.62 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  29.55 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  26.62 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  25 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  30.22 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  26.09 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  32.67 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  26.81 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  28.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  28.29 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  26.47 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  31.39 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  28.17 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  26.09 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  29.2 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  24.64 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  28.47 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  24.64 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  27.71 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  24.64 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  25.87 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  27.46 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  24.64 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  28.17 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  31.43 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  27.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  26.38 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  27.34 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  27.66 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  36.04 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  26.49 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  30.94 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  26.76 
 
 		 162 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  28.17 
 
 		 166 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  26.76 
 
 		 162 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  26.76 
 
 		 162 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  26.76 
 
 		 162 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  26.76 
 
 		 162 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  28.17 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  25.95 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  30.2 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  24.16 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  25.17 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>