31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8829 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  45.07 
 
 
239 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  42.99 
 
 
218 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  35.87 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  32.78 
 
 
182 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
186 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  31.35 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  33.97 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  29.05 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  29.44 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  30.54 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  34.65 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  29.23 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  29.21 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  28.98 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  31.4 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  27.84 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  26.37 
 
 
257 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.22 
 
 
182 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  24.54 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  24.4 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  27.78 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 
182 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  29.65 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  27.39 
 
 
198 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
187 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  27.98 
 
 
203 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28.81 
 
 
197 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
197 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>