37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4607 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  413  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  52.63 
 
 
211 aa  194  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  48.57 
 
 
210 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  47.39 
 
 
209 aa  174  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  49.25 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  50.24 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  50.24 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  48.33 
 
 
207 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  48.8 
 
 
205 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  47.62 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  42.51 
 
 
220 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  41.06 
 
 
209 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  42.03 
 
 
214 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  44.76 
 
 
209 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  41.98 
 
 
210 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  42.08 
 
 
238 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  41.83 
 
 
220 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  46.11 
 
 
205 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  47.16 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  40 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  42.33 
 
 
211 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  41.21 
 
 
207 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  39.41 
 
 
210 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  38.1 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  36.48 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  35.6 
 
 
207 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  37.95 
 
 
214 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.02 
 
 
214 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  39.61 
 
 
210 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  34.78 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.56 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  30.66 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3528  hypothetical protein  29.33 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3523  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3596  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  27.13 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  30.63 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>