10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  334  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  40.66 
 
 
266 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  32.35 
 
 
228 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  28.74 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  36.71 
 
 
484 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  33.68 
 
 
339 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2162  hypothetical protein  35 
 
 
115 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  35.44 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  36.46 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>