14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4168 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  39.78 
 
 		 664 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  40.98 
 
 		 276 aa  222  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  39.78 
 
 		 664 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  39.77 
 
 		 663 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  34.98 
 
 		 656 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  37.6 
 
 		 663 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  29.43 
 
 		 672 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  34.84 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  33.48 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  36.55 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  29.75 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  30 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  30.97 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>