28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3188 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  39.68 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  39.68 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  39.68 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  39.68 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  38.03 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  38.71 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  36.07 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  28.17 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  33.87 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  37.29 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  33.9 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  45.45 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  29.58 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  45.45 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  42.59 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  29.41 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1756  SirA family protein  46.51 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  30.65 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  29.41 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  36.73 
 
 		 81 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  30.16 
 
 		 82 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  26.47 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  26.47 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  27.94 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  25.71 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  39.22 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>