27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2535 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  878    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  54.01 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02508  hypothetical protein  52.67 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  47.82 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  45.12 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  43.46 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25.81 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  25.12 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3546  hypothetical protein  34.62 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0041915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  23.02 
 
 		 250 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  23.05 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  25.4 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  25.4 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  25.4 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  25.42 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  20.25 
 
 		 270 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  23.08 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  20.09 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  23.72 
 
 		 244 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  22.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>